Una de las mejores opciones para viajar vía aérea, es desde la ciudad de Lima a Tarapoto, luego desde Tarapoto a la ciudad de Chachapoyas, utilizando colectivos de la Empresa Turismo Selva, directo hasta la ciudad de Chachapoyas o por las tardes en buses que salen desde la ciudad de Tarapoto hasta el pueblo de Pedro Ruiz, luego tomar un colectivo desde Pedro Ruiz hasta la ciudad de Chachapoyas, recorriendo aproximadamente 335km. Con un paisaje impresionante, saliendo desde la selva baja hasta llegar al Alto Mayo, reserva que conserva gran parte de la foresta de la selva alta o denominada Rupa Rupa, para luego ingresar a la región Amazonas y poder observar los cambios de ecosistemas y paisaje hermoso que tienen ambas regiones.
Otra de las rutas es desde la ciudad de Lima hasta Chiclayo vía aérea, luego tomar los buses que salen por las noches, hasta la ciudad de Chachapoyas vía terrestre, las empresas de transporte que brindan este servicio son las siguientes: Movil Tours, Civa, Transservis Kuélap, El Expreso SAC, GH Bus.
Otra de las rutas es desde la ciudad de Lima, vía aérea hasta la ciudad de Cajamarca, luego tomar los buses desde dicha ciudad hasta la ciudad de Chachapoyas, esta ruta es considerada una de las más impresionantes, por su paisaje, cañones profundos, cordilleras campos de cultivos, ríos y ecosistemas especiales, el recorrido es de 335 Km. Vía terrestre, para esto ahora contamos con una carretera asfaltada, que nos permite viajar cómodamente hasta la ciudad de Chachapoyas atravesando valles fértiles, cañones profundos y pasos muy altos con una variada flora y fauna de nuestras regiones de Cajamarca y Amazonas.
Nuestra última opción, para llegar a la ciudad de Chachapoyas es desde nuestro país vecino el Ecuador, saliendo desde la ciudad de Vilcabamba hasta el pueblo de Zumba, luego continuar nuestro viaje a la frontera entre estos dos países denominado La Balsa, después puede continuar su viaje hasta la ciudad de San Ignacio, donde puede pernoctar para al día siguiente continuar su viaje hasta la ciudad de Jaén, luego puede tomar colectivos hasta la ciudad de Bagua Grande, desde donde tomara otro colectivo directo a la ciudad de Chachapoyas, este recorrido es de aproximadamente 460 Km. Con una duración de dos días como mínimo.